玩家可以收集到多只传说中的神兽，包括急冻鸟、闪电鸟、火焰鸟以及超梦等。这些神兽不仅拥有强大的属性和技能，其捕捉条件与栖息地也各有特点。急冻鸟位于双子岛最深处，需通过推石堵住瀑布才能抵达；闪电鸟栖息于无人发电厂内；火焰鸟则藏身于火焰山山顶。超梦作为游戏中最强的神兽之一，需在通关后前往新岛的特殊区域触发剧情才能遭遇。
捕捉神兽前需做好充分准备，包括携带足够的高级球或大师球，以及能够削弱神兽血量的宝可梦。急冻鸟为冰属性，建议使用火系或岩石系技能对抗；闪电鸟为电属性，地面系宝可梦可免疫其攻击；火焰鸟为火+飞行属性，水系或岩石系技能效果显著。超梦为超能力属性，幽灵系或恶系技能可有效克制。对神兽施加睡眠或冰冻状态能大幅提升捕捉成功率，战斗中需注意控制其血量至红色状态。
雷公、炎帝和水君需在击败四大天王后随机出现在关东地区的草丛中，且需通过特定剧情激活。洛奇亚则位于第八座彩虹岛右下方，需乘船抵达并完成前置任务。迪奥西斯需在第九座彩虹岛完成拼图挑战后出现，等级为30级。这些神兽的分布与游戏进程紧密相关，建议玩家在通关主线后再系统搜寻。
神兽的稀有性不仅体现在捕捉难度上，其战斗价值也远超普通宝可梦。急冻鸟的暴风雪与心眼组合可造成高额伤害；闪电鸟的十万伏特与啄钻具备爆发力；火焰鸟的神圣之火附带灼伤效果；超梦的精神破坏更是游戏中最强技能之一。合理培养神兽可显著提升队伍实力，但需注意其高昂的经验需求与技能搭配限制。
部分区域如双子岛、火焰山地形复杂，建议提前存档以避免意外。若初次捕捉失败，神兽不会消失，玩家可反复尝试。携带喷雾剂可减少途中野生宝可梦的干扰，节省时间。通过合理规划路线与资源，玩家能够高效集齐所有神兽，完成图鉴收藏。
